Torrentファイルでないファイルをダウンロードしようとしたときに勝手に起動してしまいます

どうしてですか？

0.75から、BitCometは、BitTorrent以外のダウンロードもサポートするようになっています。

インストール時の初期設定のままでは、ZIP RAR ISO EXE ASF AVI MP3 MPG RM RMVB WMV WMA MSI 形式のファイルのHTTP/FTPダウンロードにも、BitCometを使用する設定になってしまいます。

BitTorrent以外のダウンロードは使い慣れたダウンローダーがいいのですが

BitCometのインストール時のオプションで、

Capture IE download

のチェックを外しておくことと、

インストール後、オプションのタスク-HTTP/FTPで、

クリップボードモニターを有効にする

BitCometをIEの標準のダウンロードツールにする

IEのダウンロードをフックする

の３つのチェックを外してください。

BitCometのダウンローダーを使う価値はありませんか？

いえ。BitCometは、BitTorrentの技術を応用して、同じファイルをダウンロードしようとしているピア同士で、ダウンロード済みのピースを交換しあってサーバーの負荷を下げる、という機能や、他のダウンロードツールが持っている、ミラーサーバーを自動的に検索してそちらからもダウンロードする機能を持っているので、これらを有効にすれば、IEでのダウンロードよりははるかに強力なダウンロードツールとして動作するでしょう。

他にお気に入りのツールがあって、そちらを使う、というのでなければそのままでもいいのではないかと思います。